Fehlbildungen des Fortpflanzungssystems selbst können ebenfalls Fruchtbarkeitsstörungen verursachen. Einige dieser Fehlbildungen können angeboren sein, andere können zu einem späteren Zeitpunkt entstanden sein.

In diesem Abschnitt werden verschiedene Fehlbildungen behandelt, namentlich Fehlbildungen der Eileiter und der Gebärmutter, die alle Einfluss auf die Fruchtbarkeit haben können.